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按照规定，所有的日本居民(包括外国国籍者)都应加入公共医疗保险。日本的公共医疗保险有两种：国民健康保险和有工作单位者加入的健康保险。没有加入保险的情况下，只是因为感冒去医院看病，一次也要花大约5000日元，治疗一颗蛀牙需花数万日元，因为盲肠炎而住院一周的话，其费用近30-40万日元；在经济上会成为很大的付担。在法律上还规定在日本预定停留1年以上的外国人也都要加入国民健康保险，加入手续在市、区、街、村政厅办理，每月缴保险费；保险费金额因地区而异，没有民入的外国留学生的保险费通常可以得到减额。加入了国民健康保险后因受伤和疾病需要接受治疗的时候，如果在挂号窗口出示保险证，自己只负担适用保险诊疗部分医疗费的20%-30%，便可接受诊疗。但是保险诊疗适用的医疗费将全部由自己负担；还有，在加入国民健康保险后，在向日本国际教育协会的外国人留学生医疗费补助提出登记，国民健康保险的保险诊治箕疗费中个人负担金额的80%还可以得到补助。
登记手续向所在大学等的承辩课办理。要注意保险诊治适用外的医疗费用不受补助。因而，将国民健康保险和外国人留学生医疗费补助制度合起来的话，外国留学生的保险内诊治医疗费的个人负担金额仅是全部医疗费的4-6%即可；另外，如接受外来诊治，开药方也要一定的负担，这时也可以外国留学生医疗费制定补助。
